武汉大学病毒学国家重点实验室揭示新冠肺炎患者支气管肺泡灌洗液与外周血单核细胞的转录组学特征
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转载 武汉大学病毒学国家重点实验室揭示新冠肺炎患者支气管肺泡灌洗液与外周血单核细胞的转录组学特征
陈婉仪
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2020-3-11
该论文研究结果揭示了患者SARS-CoV-2感染的不同宿主炎症细胞因子谱,并揭示了COVID-19发病与细胞因子过度释放之间的关联。

来源:病毒学界

2020年3月9日,预印本网站SSRN在线发布武汉大学病毒学国家重点实验室陈宇、蓝柯和周宇团队的研究论文,题为Transcriptomic Characteristics of Bronchoalveolar Lavage Fluid and Peripheral Blood Mononuclear Cells in COVID-19 Patients(新冠肺炎患者支气管肺泡灌洗液与外周血单核细胞的转录组学特征)。

持续在中国及其他75个国家和地区中传播的COVID-19暴发和流行对公众健康构成了巨大威胁。由于对这种疾病的宿主免疫反应的了解有限,阻碍了有效鉴定支持治疗药物和治疗方法的努力。为了表征宿主对SARS-CoV-2感染的炎症反应的转录特征,该联合团队对从COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)和外周血单核细胞(PBMC)样本中提取的RNA进行了转录组测序。

该论文研究结果揭示了患者SARS-CoV-2感染的不同宿主炎症细胞因子谱,并揭示了COVID-19发病与细胞因子过度释放(例如CCL2 / MCP-1,CXCL10 / IP-10,CCL3 / MIP-1A以及CCL4 / MIP1B)之间的关联(图1)。这些数据的及时发布可以帮研究者比较精确地确定COVID-19患者肺泡中巨噬细胞和PBMC表达变化的炎症因子,该转录组数据集将为抗炎药物的临床指导和深入研究宿主反应的分子机制提供支撑。

图1 支气管肺泡灌洗液(BALF)和外周血单核细胞(PBMC)样本中细胞因子热力图

此外,根据已经发表的临床和尸检报告,患者在疾病进程中出现淋巴细胞急剧下降,根据对COVID-19患者血液中PBMC进行转录组分析,发现SARS-CoV-2诱导淋巴细胞凋亡和P53信号通路的激活,可能是患者淋巴细胞减少的原因(图2)。

图2 外周血单核细胞(PBMC)样本自噬,凋亡,P53信号通路热力图

该论文相关的数据集已上传到中国基因组数据中心(National Genomics Data Center)网站为https://bigd.big.ac.cn/),序列号为PRJCA002326。该工作由武汉大学病毒学国家重点实验室、武汉大学中南医院、中山大学医学院和华大基因共同协作完成,并得到了武汉大学新冠肺炎科技攻关专项项目和泰康集团及北京泰康溢彩公益基金会等的大力支持。

本期编辑:horizon

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